Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
OtcP11725 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
OtcP11725 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
OtcP11725 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms