Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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DmdP11531 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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DmdP11531 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DmdP11531 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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DmdP11531 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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