Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P01661 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P01661 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P01661 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms