Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lnx1O70263 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms