Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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