Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Casq1O09165 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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