Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hps1O08983 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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