Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21310J3QQ23 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms