Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms