Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cldn34c3J3QJW5 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms