Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Arfgef1G3X9K3 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Arfgef1G3X9K3 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Arfgef1G3X9K3 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Arfgef1G3X9K3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arfgef1G3X9K3 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms