Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
XntrpcF8VQM8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
XntrpcF8VQM8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms