Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Arid4aF8VPQ2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms