Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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H2-M1F7CXU4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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