Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Heatr9-201ENSMUST00000019069 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 1700061E17Rik-201ENSMUST00000185439 1067 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tia1-202ENSMUST00000095753 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm43041-201ENSMUST00000200022 2630 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC170188.1-201ENSMUST00000223710 1963 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slc25a35-201ENSMUST00000018884 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Golm1-202ENSMUST00000095739 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Lrrcc1-201ENSMUST00000091325 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Nell1-202ENSMUST00000107603 2756 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Uroc1-202ENSMUST00000164761 3462 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Crx-204ENSMUST00000174318 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm37522-201ENSMUST00000195437 2884 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ces2g-201ENSMUST00000043183 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm44013-201ENSMUST00000204392 2262 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Btbd16-201ENSMUST00000048453 3434 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tmod2-203ENSMUST00000164100 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Trpv2-202ENSMUST00000102643 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm20518-201ENSMUST00000150068 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Tdpoz1-202ENSMUST00000181541 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Dhx30-204ENSMUST00000196171 3885 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Ptprr-207ENSMUST00000155606 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Hemgn-202ENSMUST00000107764 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm20538F6Z9R1 Apol7a-204ENSMUST00000176074 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms