Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Gm8005F6YKY3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Gm8005F6YKY3 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Gm8005F6YKY3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm8005F6YKY3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
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