Protein–RNA interactions for Protein: F6W8I0

Yjefn3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yjefn3F6W8I0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Yjefn3F6W8I0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Yjefn3F6W8I0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Yjefn3F6W8I0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Yjefn3F6W8I0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Yjefn3F6W8I0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Yjefn3F6W8I0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Yjefn3F6W8I0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Yjefn3F6W8I0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Yjefn3F6W8I0 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Yjefn3F6W8I0 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Yjefn3F6W8I0 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.5 ms