Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3020E9Q3J7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3020E9Q3J7 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms