Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cfap46E9Q2C0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cfap46E9Q2C0 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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