Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Olfr333-ps1-201ENSMUST00000122311 940 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atad2bE9Q166 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms