Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms