Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3543D3Z235 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms