Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce3B5KM66 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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