Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ctnna3-201ENSMUST00000075099 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 AC117245.4-202ENSMUST00000214403 3816 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Sfi1-201ENSMUST00000066391 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tmem238A9JSM3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms