Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms