Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3839S4R1W1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3839S4R1W1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3839S4R1W1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm3839S4R1W1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm3839S4R1W1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3839S4R1W1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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