Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pdpk1Q9Z2A0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pdpk1Q9Z2A0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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