Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn8Q9Z260 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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