Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms