Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn13Q9Z0S4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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