Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ChmQ9QXG2 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChmQ9QXG2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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