Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Reep6Q9JM62 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms