Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Kcnq4Q9JK97 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Kcnq4Q9JK97 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Kcnq4Q9JK97 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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Kcnq4Q9JK97 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Kcnq4Q9JK97 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Kcnq4Q9JK97 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Kcnq4Q9JK97 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Kcnq4Q9JK97 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Kcnq4Q9JK97 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms