Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cmtm7Q9ESD6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cmtm7Q9ESD6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms