Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms