Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc6bQ9D289 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc6bQ9D289 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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