Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Pbdc1Q9D0B6 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pbdc1Q9D0B6 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pbdc1Q9D0B6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pbdc1Q9D0B6 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pbdc1Q9D0B6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pbdc1Q9D0B6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pbdc1Q9D0B6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pbdc1Q9D0B6 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pbdc1Q9D0B6 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pbdc1Q9D0B6 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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