Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc47Q9D024 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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