Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc77Q9CZH8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms