Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddx28Q9CWT6 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddx28Q9CWT6 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddx28Q9CWT6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddx28Q9CWT6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddx28Q9CWT6 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddx28Q9CWT6 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddx28Q9CWT6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddx28Q9CWT6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddx28Q9CWT6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.8 ms