Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DenrQ9CQJ6 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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