Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Commd4Q9CQ02 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms