Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SrrtQ99MR6 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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