Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PccbQ99MN9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms