Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp1b4Q99ME6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms