Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prpf19Q99KP6 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms