Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pacsin3Q99JB8 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms