Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rnf144aQ925F3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms