Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms