Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ttc39cQ8VE09 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39cQ8VE09 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39cQ8VE09 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttc39cQ8VE09 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms